Небольшая усадьба, граничащая с обширными владениями Г.П. Гагарина, в конце XVIII – начале XIX веков принадлежала жене коллежского асессора Марфе Протковой. Главный дом усадьбы – на каменном фундаменте деревянный одноэтажный с антресолями, построенный в 1809 году – размещается по красной линии проезда вдоль Земляного вала.

Чудом не задетый пожаром 1812 года, в 1815 году дом приобрел соответствующие времени ампирные черты. Архитектор О.И. Бове украсил его богатой лепниной и массивным тосканским портиком, вынесенным далеко вперед и образующим своеобразную террасу.

Со второй половины XIX века дом принадлежал семье Коншиных – купцу, потомственному дворянину, владельцу мануфактуры в Серпухове Николаю Николаевичу и его жене Ольге Николаевне, урожденной Добрыниной. В семье было много детей, в том числе и от первого брака Н. Коншина. В 1881 году владельцы произвели капитальный ремонт с частичной заменой потолочных балок, венцов и оконных рам.

В 1897 году в соседнем владении разместилась детская Софийская больница. Через год сыновья Коншиных продали ей свои земли. С этого времени ворота усадьбы стали главным въездом в больницу, а деревянный дом – частью больничных владений, квартирой главного доктора. В разное время здесь жили замечательные врачи Н.В. Яблоков, Е.А. Покровский, Н.Ф. Филатов. Именем последнего больница стала называться в 1922 году.

Во время революционных событий 1905 года в результате артиллерийского обстрела Пресни дом пострадал от снарядов.

В 1985 году в доме были начаты реставрационные работы, которые, с большим перерывом, продолжались несколько десятилетий. Особое внимание реставраторов было обращено на восстановление уникальных интерьеров дома. В нем сохранилась первоначальная анфиладная планировка, частичная лепнина потолков, старинные изразцовые печи, колонны. Благодаря кропотливой работе реставраторов воссоздано первоначальное убранство дома: зеленая, малиновая, золотисто-охристая гостиные, дубовая лестница и великолепная лепнина. В отреставрированном доме Филатовская больница предполагает открыть музей.