Небольшой неоклассический особняк в Гранатном переулке был построен в 1899-1900 годах для Вильгельмины Ивановны Рекк, жены известного предпринимателя Якова Андреевича Рекка, основателя одной из крупнейших домостроительных компаний Москвы – Московского торгово-строительного акционерного общества.

На рубеже веков Рекк взялся за реализацию в Москве новой идеи, пришедшей из Европы – строить особняки «под ключ», то есть полностью оснащенными и готовыми для жизни, для последующей их перепродажи. Целью Якова Рекка было, по его же собственным словам, «украсить Москву стильными домами, которые, имея технические удобства западноевропейских городских строений, в то же время не убивали бы национального колорита Москвы». За годы деятельности строительного общества Рекка им было построено немало особняков в стиле модерн, и в неоклассическом стиле. Одним из таких домов был, по всей видимости, и особняк в Гранатном переулке.

Особняк был построен в стиле неогрек с элементами неоклассицизма, в его проектировании принимал участие известный архитектор Владимир Владимирович Шервуд. Позже, в 1905 году, к зданию с правой стороны была сделана пристройка, выполненная по проекту другого видного архитектора начала ХХ века - Владимира Дмитриевича Адамовича. Ассиметрично решенный фасад особняка украшен изящным лепным декором – наличники окон (особенно пышно оформлено большое окно пристройки), карниз, фризы с сюжетами на античные темы – в композиции портика второго этажа и над окном пристройки. Портик второго этажа, расположенный над входом в здание, оформлен двумя колоннами ионического ордера и увенчан фронтоном. В особняке частично сохранилось декоративное убранство интерьеров, выполненное так же в неоклассическом стиле.

Некоторое время спустя после окончания строительства, особняк был продан потомственному почетному гражданину, купцу 1-й гильдии Николаю Алексеевичу Протопопову. Протопопов дослужился до чина действительного статского советника, был выборным Московского купеческого сословия, управляющим Российского общества Красного Креста, почетным членом Совета детских приютов. Немало сделал он и на ниве благотворительности – в частности, пожертвовал средства на строительство и содержание Московского коммерческого института в Стремянном переулке; также на его средства был создан Ассирийский зал в Музее изящных искусств (нынешний Музей изобразительных искусств им. А.С. Пушкина). Протопопов был связан тесными узами с семьей купцов Бахрушиных – его женой была Клавдия Александровна Бахрушина (сестра основателя Театрального музея Алексея Александровича Бахрушина).

Последние несколько лет перед революцией 1917 года особняком в Гранатном переулке владел потомственный дворянин Семен Александрович Назаров.

После национализации дома здесь размещались различные советские учреждения, среди которых Высший военный совет Народного комиссариата по военным делам и общежитие Красного Интернационала профсоюзов.

В настоящее время в особняке располагается посольство Республики Таджикистан.