24 июня 1901 года на берегу Яузы состоялось открытие и освящение «Московского казённого винного склада №1» (первое название завода). Это место было выбрано не случайно, здесь находились артезианские скважины, славившиеся своей водой. Здание склада — замечательный образец промышленной архитектуры начала XX века, сохранивший свой исторический облик и сегодня. «Винный склад №1» являлся самым крупным и мощным предприятием в стране. К 1914 г. ассортимент выпускаемой продукции расширился до пяти наименований: теперь здесь выпускали водки «Московскую особенную», «Хлебное вино», «Столовое вино», «Горилку» и наливку «Запеканка». С 1914 по 1925 г. завод был закрыт в связи с введением в стране «сухого закона» на период войны. Некоторое время в его здании располагался военный госпиталь, однако запрет на производство не был абсолютным. Склад №1 производил спирт для нужд армии и «учреждений народного здравия», отпускал вино иностранным гражданам и дипломатическому корпусу, выполнял заказы на поставку спирта союзнической Франции. Часть производственных мощностей была переориентирована на выпуск лекарственных средств на спиртовой основе.

22 июля 1941 года, во время массированного налёта немецкой авиации на Москву, от попадания бомбы почти полностью выгорел главный корпус завода. Несмотря на продолжавшиеся бомбёжки, самоотверженными усилиями работников завода было восстановлено и налажено полноценное производство.

В годы Великой Отечественной войны завод освоил военное производство. Производились противотанковые зажигательные бутылки — «коктейли Молотова», фугасные огнемёты, авиабомбы, паста для подогрева пищи бойцам, а также продолжался разлив водки для нужд фронта.

После Великой Победы завод полностью переключился на производство мирной продукции.

В 1953 году на заводе была создана знаменитая водка «Столичная». Её автором был винокур экстра-класса В. Г. Свирида. Уже в 1954 г. этот сорт получает международное признание: при проведении процедуры «слепого тестирования» водка «Столичная» победила знаменитую марку Smirnoff. В январе 1987 г. завод получает своё нынешнее название «Кристалл».

Завод «Кристалл» постоянно совершенствует производственные технологии, сверяясь с меняющимися мировыми стандартами. За почти 110-летнюю историю завода его продукция завоевала множество различных российских и международных наград: 104 Гран-при, 17 Национальных премий, 115 золотых медалей и более 120 почётных дипломов.

Комплект из штофа и стопок «Пей-пей — увидишь чертей!» изготовлен на Императорском стекольном заводе в 1897 году.